بیولوژیک

دانشمندان در تلاشند تا معیارهای ابرداده داده محور جامعه را برای تحقیقات میکروبی ایجاد کنند

GB Dundor Arias ، استادیار آسیب شناسی گیاه در دانشگاه ایالتی کالیفرنیا ، مونتری بی بی می گوید: "ما در اثر انفجار در دسترس بودن داده های میکروبی زندگی می کنیم." "در سیستم های کشاورزی ، گسترش تحقیقات در مورد میکروب های گیاهی و گیاهی با هیجان بالقوه ای که ممکن است داده های میکروبی برای توسعه استراتژی های جدید ، پایدار و مؤثر برای مدیریت محصول وجود داشته باشد ، همراه بوده است."

اگرچه این یک پیشرفت مهیج است ، به عنوان مجموعه جمعی از داده های میکروبی برای انواع محصولات رشد می کند ، ناهماهنگی در ثبت داده ها استفاده از داده ها را در پروژه های تحقیقاتی دشوار می کند. در مقاله اخیر در مجله Vitobiumsداندور آریاس و دیگران در زمینه وی در مورد نیاز به معیارهای ابرداده کشاورزی برای تحقیقات میکروبیوم صحبت می کنند.

داده های فوق داده به عنوان "داده های مربوط به داده های دیگر" یا به عبارت دیگر ، داده ها یا نمونه ، چه كجا ، چه زمانی و چگونه داده ها شناخته شده است. عوامل دیگر ، "توضیح می دهد Dundore-Arias. "ایجاد یک اجماع مشترک در مورد گزارش در مورد نمونه میکروبیوم برای توسعه زمینه ما بسیار مهم است."

ابرداده های مداوم به محققان این امکان را می دهد تا تعیین کنند که آیا داده های سایر مطالعات می تواند برای تجزیه و تحلیل در تحقیقات خود ترکیب شود. شیوه های ثبت نام و به اشتراک گذاری استاندارد نیز پایه ای جدی برای ایجاد فهم و افزایش ارزش بلند مدت داده های میکروبیوم در جامعه بهداشت گیاهان ایجاد می کند.

از طریق کارگاه آموزشی که توسط شبکه هماهنگی تحقیقات میکروبیولوژی کشاورزی بنیاد ملی علوم ، Dundore-Arias ، Emiley Eloe-Fadrosh (LBNL ، DOE-JGI) ، لین لین شریمل (کالج پزشکی دانشگاه مریلند) و لیندا کینکل (دانشگاه مینسوتا) حمایت شده است. مشارکت جامعه پژوهش در یک فرآیند باز برای ایجاد اجماع در مورد معیارهای ابرداده میکروبی کشاورزی.

آنها چک لیست ای از استانداردهای فوق داده مورد نظر و مورد نظر را پیشنهاد کردند که هدف آن تحریک بحث و حرکت جامعه به سمت گزارش دهی فوق داده استاندارد ، نمونه برداری ، پردازش و خطوط لوله تحلیلی در تحقیقات میکروبیوم کشاورزی است. پس از جمع آوری نظرات ، طبق گفته Dundore-Arias ، مرحله بعدی "توسعه است که اعضای انجمن استاندارد های ژنومی (GSC) ، متادیتای استاندارد استاندارد MIxS-Ag و کلامی را که در گروه GSC MIxS گنجانیده می شود و راه اندازی کرده و به سایر سیستم عاملهای مشترک داده و مخزن تبدیل می کنند. استفاده کنید. "

در طی مراحل تهیه این لیست پیشنهادی از رده های استاندارد ابرداده و در مرحله بعد ، تهیه لیست چک لیست معیارهای فوق داده برای توصیف مطالعات میکروبیوم کشاورزی (MIxS-Ag) ، دندور-آریاس و همکارانش همچنان به دریافت نظرات و پشتیبانی میکروبیولوژیست های کشاورزی که نماینده انواع مختلفی هستند ، می پردازند. بخش های دولتی و خصوصی. نظرات را می توان در نظرات در انتهای مقاله در اینجا ارسال کرد.


رژیم غذایی و تغذیه تأثیرات عمیقی بر روی میکروبهای روده دارند


اطلاعات بیشتر:
J. P. Dundore-Arias و همکاران ، استاندارد های ابرداده مبتنی بر جامعه برای تحقیقات میکروبیوم کشاورزی ، مجله Vitobiums (2020) دوی: 10.1094 / pbiomes-09-19-0051-پ

ارائه شده توسط
انجمن آسیب شناسی گیاهی آمریکا

نقل قول:
دانشمندان به دنبال ایجاد معیارهای ابرداده جامعه محور برای تحقیقات میکروبی هستند (2020 ، 25 مارس)
برگرفته در 25 مارس 2020
از https://phys.org/news/2020-03-s Scientists-community-driven-metadata-standards-microbiomes.html

این سند مشمول حق چاپ است. گذشته از هرگونه رفتار منصفانه به منظور مطالعه و تحقیقات خصوصی ، شماره
این قسمت را می توان بدون اجازه کتبی کپی کرد. مطالب فقط برای اهداف اطلاعاتی ارائه شده است.

نوشته های مشابه

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

یک × 4 =

دکمه بازگشت به بالا
بستن